184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2452 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  100 
 
 		 101 aa  209  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  99.01 
 
 		 101 aa  207  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  77.89 
 
 		 104 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  76.04 
 
 		 105 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  68.32 
 
 		 101 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  68.42 
 
 		 102 aa  151  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  63.83 
 
 		 107 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  63.16 
 
 		 96 aa  135  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  61.36 
 
 		 92 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  72.6 
 
 		 103 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  45.83 
 
 		 104 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  54.17 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  50.98 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  50 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  40.26 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  40.26 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  45.28 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  44 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  52 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  45.28 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  49.06 
 
 		 182 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  40.23 
 
 		 459 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  41.79 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  53.49 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  47.17 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 204 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 174 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  38.24 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 236 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  40 
 
 		 186 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1723  HNH nuclease  53.33 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.921943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  44 
 
 		 184 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  39.08 
 
 		 459 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  45.65 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  43.75 
 
 		 181 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  39.62 
 
 		 185 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  47.92 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  39.71 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 198 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  45.61 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  48.28 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  44 
 
 		 205 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  49.02 
 
 		 198 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  42.31 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  43.14 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  43.75 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  32.84 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  32.84 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  32.84 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  50 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  51.16 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  45.83 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 189 aa  48.1  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3842  HNH nuclease  40.68 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20921  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  43.14 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  43.75 
 
 		 204 aa  47.4  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 196 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  31.34 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  42 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  42 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 552 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  36.07 
 
 		 185 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  37.5 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  43.14 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  40 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  48.84 
 
 		 194 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  45.1 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  40.58 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.575523  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>