192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0936 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  100 
 
 
104 aa  215  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  74.74 
 
 
105 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  76.34 
 
 
101 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2934  HNH endonuclease  63.37 
 
 
102 aa  150  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0985  HNH endonuclease  66.67 
 
 
107 aa  147  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.761066  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  77.89 
 
 
101 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  76.84 
 
 
101 aa  140  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  64.52 
 
 
96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  69.51 
 
 
103 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  59.34 
 
 
92 aa  131  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2932  HNH nuclease  47.5 
 
 
104 aa  92  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.515659  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  44.78 
 
 
196 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  52.73 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  43.28 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  50 
 
 
185 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  41.79 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  41.79 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  43.08 
 
 
205 aa  58.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  40.62 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  49.06 
 
 
185 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  41.79 
 
 
194 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  49.02 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  40.3 
 
 
199 aa  55.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  40.91 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  38.81 
 
 
181 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  52 
 
 
186 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  40.3 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  39.47 
 
 
213 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  40.62 
 
 
220 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  47.17 
 
 
185 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  41.79 
 
 
185 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  38.81 
 
 
202 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  40.3 
 
 
186 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  40.79 
 
 
197 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  40.79 
 
 
168 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  47.06 
 
 
191 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  47.69 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  37.31 
 
 
193 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  44.44 
 
 
187 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  38.81 
 
 
185 aa  53.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  53.85 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  46.97 
 
 
183 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  49.02 
 
 
185 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  53.85 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  41.54 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  53.85 
 
 
182 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  46.97 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  50 
 
 
216 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  41.27 
 
 
205 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  42.42 
 
 
196 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  40.58 
 
 
189 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  50 
 
 
185 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0328  HNH nuclease  44.78 
 
 
122 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00373228  normal  0.021942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  46.03 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  42.86 
 
 
193 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  37.31 
 
 
185 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  39.06 
 
 
186 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  51.16 
 
 
171 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  40.91 
 
 
187 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14600  predicted protein  45.65 
 
 
145 aa  52  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  47.92 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  48.84 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  47.06 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  37.31 
 
 
194 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  52 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  47.92 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  37.31 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  37.31 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  42.03 
 
 
189 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  53.49 
 
 
204 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  45.45 
 
 
179 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  39.06 
 
 
204 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  42.86 
 
 
169 aa  50.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  50.94 
 
 
146 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  48.84 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  45.71 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  39.39 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  43.48 
 
 
189 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  47.92 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  53.49 
 
 
197 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  48 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  37.5 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  41.54 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  40 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  48.28 
 
 
459 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  39.06 
 
 
221 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  41.94 
 
 
169 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  47.83 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  47.92 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  51.16 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  47.92 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  42.86 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  51.16 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  50.98 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  35.82 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  53.49 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  43.55 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  48.84 
 
 
170 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  47.17 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  38.64 
 
 
459 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>