94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2450 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  100 
 
 
143 aa  299  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  47.52 
 
 
142 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4619  HNH endonuclease  45.71 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4463  HNH endonuclease  47.45 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0227  HNH endonuclease  41.43 
 
 
149 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2748  HNH nuclease  39.44 
 
 
143 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99438  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  48.98 
 
 
459 aa  52.8  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  46.94 
 
 
459 aa  51.2  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  65.71 
 
 
438 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  43.75 
 
 
443 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  36.23 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  36.23 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  46 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  42.19 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  48.98 
 
 
461 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  36.92 
 
 
321 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  30.34 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  34.09 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  61.76 
 
 
459 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  47.83 
 
 
471 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  44.68 
 
 
427 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  40.62 
 
 
168 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  40 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  28.83 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  28.83 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  27.93 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  39.44 
 
 
427 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  34.09 
 
 
185 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  37.5 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  40 
 
 
452 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  38.57 
 
 
585 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  38.1 
 
 
189 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  32.84 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2010  HNH endonuclease  34.78 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  50 
 
 
115 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1198  HNH endonuclease  37.04 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.938412  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  32.95 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  44.9 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5481  HNH endonuclease  44 
 
 
465 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229797 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5402  HNH endonuclease  44 
 
 
465 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.243535  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  40 
 
 
240 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  30.88 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  31.82 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  27.1 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  24.49 
 
 
1138 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4548  HNH endonuclease  31.76 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  38.89 
 
 
166 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  35.71 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  40.98 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  38.98 
 
 
205 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  33.33 
 
 
552 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  40.82 
 
 
199 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  41.82 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  34.09 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  33.85 
 
 
560 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  30.86 
 
 
189 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  39.22 
 
 
169 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  26.36 
 
 
165 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  47.62 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  25.23 
 
 
167 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  44.9 
 
 
477 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  38.98 
 
 
111 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  33.33 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  40.35 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  36.76 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2162  HNH endonuclease  56.67 
 
 
250 aa  41.2  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.097975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  28.57 
 
 
220 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1699  HNH endonuclease  50 
 
 
481 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0812622  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  31.52 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  29.67 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  27.27 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  38 
 
 
194 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  31.82 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6155  HNH endonuclease  27.55 
 
 
126 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.213554  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  38 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  35.14 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  38 
 
 
194 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  29.67 
 
 
186 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  33.87 
 
 
177 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  26.17 
 
 
165 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  36.67 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  39.34 
 
 
454 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  30.93 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.96 
 
 
607 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  34.21 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.96 
 
 
607 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.96 
 
 
607 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  27.96 
 
 
607 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  25.58 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  31.25 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  58.06 
 
 
464 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  25.58 
 
 
198 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  30 
 
 
185 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  30 
 
 
185 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>