168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0227 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0227  HNH endonuclease  100 
 
 
149 aa  310  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2748  HNH nuclease  46.85 
 
 
143 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99438  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4619  HNH endonuclease  44.29 
 
 
143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4463  HNH endonuclease  45.8 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  44.2 
 
 
142 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  41.43 
 
 
143 aa  110  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  42.17 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  40.24 
 
 
221 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  37.93 
 
 
204 aa  60.1  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  37.93 
 
 
186 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  35.87 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  36.59 
 
 
220 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  43.06 
 
 
174 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  39.74 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  39.74 
 
 
197 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  36.47 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  36.47 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  43.21 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  37.31 
 
 
560 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  34.88 
 
 
168 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  40 
 
 
454 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  36.84 
 
 
171 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  38.75 
 
 
189 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  33.73 
 
 
167 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  40 
 
 
174 aa  50.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  33.72 
 
 
170 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  32.47 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  36.92 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  32.94 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  40.74 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0774  HNH endonuclease  35.37 
 
 
182 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  33.33 
 
 
169 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  36.23 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  36.36 
 
 
585 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  32.94 
 
 
165 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  32.97 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  32.98 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  32.97 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  38.33 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  45.76 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  36.62 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  38.33 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  41.18 
 
 
186 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  42.17 
 
 
185 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  30.11 
 
 
165 aa  47.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  30.49 
 
 
204 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  44.44 
 
 
185 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  34.29 
 
 
199 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  30.95 
 
 
166 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  36.21 
 
 
177 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  42.59 
 
 
191 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  38.98 
 
 
160 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  33.8 
 
 
459 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  35 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  36.21 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  36.07 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  36.21 
 
 
176 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  38.89 
 
 
185 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  34.43 
 
 
443 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  30.85 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  36.07 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  45.45 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  34.52 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  43.75 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  35 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  43.86 
 
 
185 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  46.94 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  33.33 
 
 
189 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  33.33 
 
 
427 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  35.21 
 
 
193 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  30.49 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  34.43 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  43.75 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.33 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  38.33 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  32.56 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  37.5 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  36.76 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  40.35 
 
 
188 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  32.79 
 
 
438 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  35.53 
 
 
183 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  29.27 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  42.59 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  29.27 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  32.56 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  34.15 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  34.43 
 
 
477 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  35.53 
 
 
183 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3989  HNH endonuclease  31.33 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.519886 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  41.82 
 
 
196 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  32.39 
 
 
459 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  33.72 
 
 
199 aa  44.7  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  31.76 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  30 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  37.04 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  36.92 
 
 
186 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  32.53 
 
 
179 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  35.59 
 
 
422 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  35.59 
 
 
464 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  33.33 
 
 
177 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>