33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2748 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2748  HNH nuclease  100 
 
 
143 aa  301  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99438  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4619  HNH endonuclease  49.65 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4463  HNH endonuclease  51.88 
 
 
151 aa  159  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0227  HNH endonuclease  46.85 
 
 
149 aa  140  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  38.69 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  39.44 
 
 
143 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  32.61 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  41.07 
 
 
459 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  26.97 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  29.07 
 
 
174 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  28.77 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  37.04 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  28 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  33.78 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  33.78 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  35.59 
 
 
477 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  33.78 
 
 
185 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  31.03 
 
 
169 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  33.9 
 
 
454 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  33.78 
 
 
216 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  35.59 
 
 
452 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  32.2 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  28.57 
 
 
196 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  31.82 
 
 
198 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  35.19 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  28.33 
 
 
205 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  23.96 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  32.14 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  32.14 
 
 
165 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  35.48 
 
 
174 aa  40.4  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  33.9 
 
 
443 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  29.23 
 
 
177 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  32.76 
 
 
186 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>