70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2010 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2010  HNH endonuclease  100 
 
 		 118 aa  240  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.79067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02521  HNH endonuclease domain protein  35.16 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439463  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  35.56 
 
 		 438 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 1138 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 427 aa  45.4  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1023  HNH endonuclease domain protein  42.25 
 
 		 454 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  32.93 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  33.77 
 
 		 427 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  29.87 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  32.94 
 
 		 452 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  28.26 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  48.57 
 
 		 167 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4405  HNH endonuclease  31.76 
 
 		 477 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0177666  normal  0.269111 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  37.74 
 
 		 187 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4527  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000580213  normal  0.505709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  28 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0122  HNH endonuclease  29.63 
 
 		 427 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  37.74 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  50 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  37.74 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  50 
 
 		 194 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  32.69 
 
 		 443 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  35.94 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  48.57 
 
 		 166 aa  41.6  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  31.17 
 
 		 165 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  31.52 
 
 		 459 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 177 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4463  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  28.89 
 
 		 198 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  38.6 
 
 		 471 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  54.55 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  28.89 
 
 		 198 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  28.89 
 
 		 204 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  30.3 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  32.84 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  32.76 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  31.52 
 
 		 459 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  37.74 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  34.85 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  30 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  42.22 
 
 		 185 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  51.52 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 183 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4331  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 464 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  44.74 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  44.74 
 
 		 190 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  30.49 
 
 		 461 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0227  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4619  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  29.89 
 
 		 560 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  43.24 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  45.95 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 216 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>