61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1094 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  100 
 
 		 115 aa  240  5e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  61.74 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  61.74 
 
 		 119 aa  152  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  59.13 
 
 		 119 aa  147  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  57.76 
 
 		 118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  58.26 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  46.36 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  39.81 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  39.64 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  38.18 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  36.94 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  36.94 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  40.37 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  38.53 
 
 		 116 aa  68.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  36.75 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  34.75 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  37.27 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  37.72 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  33.05 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  44.29 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  32.8 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  34.18 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  41.25 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  40 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 282 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  35.21 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  29.23 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  34.18 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  40.3 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  31.17 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  54.05 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  34.67 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  43.48 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  51.61 
 
 		 234 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  50 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  35.19 
 
 		 277 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  50 
 
 		 260 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  35.48 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 282 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  35.09 
 
 		 125 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 221 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  32.53 
 
 		 132 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  29.58 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  31.11 
 
 		 471 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  31.11 
 
 		 471 aa  40.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2519  hypothetical protein  29.03 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  37.25 
 
 		 226 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  36.84 
 
 		 145 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>