50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1844 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  45.04 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1305  HNH endonuclease  54.55 
 
 		 146 aa  90.9  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.500836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  53.23 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3512  phage-like protein  38.81 
 
 		 98 aa  51.2  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.88204  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3433  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 98 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0175216  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  38.46 
 
 		 299 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 127 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  36.92 
 
 		 116 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  40 
 
 		 459 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3431  Gp54 protein  35.82 
 
 		 98 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0094955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1129  HNH endonuclease  40.62 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497129  unclonable  0.00000789585 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 459 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  33.33 
 
 		 111 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0461  prophage lambdaba04, gp54  35.82 
 
 		 100 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0440  prophage LambdaBa04, Gp54  35.82 
 
 		 100 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.8645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  32.05 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  34.78 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 111 aa  44.7  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  36 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  38.71 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  25.41 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  31.93 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3410  HNH endonuclease domain protein  42.59 
 
 		 422 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  39.19 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  44 
 
 		 197 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 80 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  30.77 
 
 		 111 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  37.68 
 
 		 80 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 174 aa  42  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  44 
 
 		 168 aa  42  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  37.7 
 
 		 185 aa  42  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  39.71 
 
 		 120 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2684  HNH nuclease  35.19 
 
 		 234 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165249  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  39.71 
 
 		 120 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 138 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  40.98 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  39.34 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  35.38 
 
 		 113 aa  41.2  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 443 aa  40.8  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 172 aa  41.2  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>