145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3190 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  291  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  59.02 
 
 		 130 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  35.63 
 
 		 459 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3583  HNH nuclease  36.62 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  35.63 
 
 		 459 aa  57  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  42.65 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  39.33 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  40 
 
 		 167 aa  50.1  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  41.94 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  41.51 
 
 		 96 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  37.93 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  40.45 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  50 
 
 		 182 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  42.59 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 438 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  41.43 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  42.59 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  50 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 197 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  27.66 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2301  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 186 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.721918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  48.21 
 
 		 183 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2411  HNH endonuclease  31.91 
 
 		 315 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  40.26 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  48.21 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4555  HNH endonuclease  48.21 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00702162  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  34.48 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2850  HNH endonuclease  34.38 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.440476  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  40.26 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  48.21 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  34.48 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  37.14 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  33.71 
 
 		 427 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  34.29 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2339  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 198 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  41.38 
 
 		 176 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  32.39 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  41.38 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  34.29 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  34.29 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  33.82 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5462  hypothetical protein  33.78 
 
 		 335 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.99145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 181 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  45.61 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  43.64 
 
 		 198 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  32.86 
 
 		 205 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 199 aa  43.5  0.0009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  42.03 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0057  HNH endonuclease  34.55 
 
 		 427 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  37.14 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 166 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  31.33 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00301  HNH endonuclease:HNH nuclease  35.71 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  27.08 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  37.14 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  32.39 
 
 		 443 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  33.82 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 221 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  34.48 
 
 		 240 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  40 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2783  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>