55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5002 on replicon NC_013746
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  100 
 
 		 221 aa  453  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  50 
 
 		 299 aa  85.9  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  43.66 
 
 		 80 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  43.66 
 
 		 80 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  41.77 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  42.25 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  47.46 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4626  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 69 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  40.58 
 
 		 81 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  43.48 
 
 		 436 aa  51.6  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  34.09 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  39.06 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  36.99 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  29.13 
 
 		 438 aa  49.7  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  42.03 
 
 		 422 aa  48.9  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  35.38 
 
 		 170 aa  48.1  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3259  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298488 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 174 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 172 aa  46.2  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  32.26 
 
 		 175 aa  45.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  35.82 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  35 
 
 		 171 aa  45.1  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  28.92 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  35.29 
 
 		 133 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  30.99 
 
 		 585 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  45.65 
 
 		 119 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 552 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  34.43 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 101 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2077  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 459 aa  43.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.343386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 459 aa  42.7  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  33.87 
 
 		 181 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 177 aa  43.1  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3148  HNH nuclease  33.33 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 452 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4861  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 472 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  45.65 
 
 		 118 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  45.65 
 
 		 119 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  29.67 
 
 		 111 aa  42  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  32.81 
 
 		 111 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3306  HNH endonuclease  45 
 
 		 461 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  27.85 
 
 		 167 aa  42  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  38.1 
 
 		 115 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  33.78 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 309 aa  41.6  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 168 aa  41.6  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35 
 
 		 168 aa  41.6  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 276 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  29.7 
 
 		 165 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>