35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0240 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  100 
 
 		 324 aa  676    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3148  HNH nuclease  42.8 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2975  hypothetical protein  36.78 
 
 		 645 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0026  hypothetical protein  34.45 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.410419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  26.75 
 
 		 967 aa  90.1  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  28.02 
 
 		 1597 aa  87  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4270  HNH nuclease  41.24 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.740281  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  33.11 
 
 		 2759 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1636  HNH endonuclease  41 
 
 		 277 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1122  HNH endonuclease  28.22 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  24.57 
 
 		 268 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  39.68 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  36.05 
 
 		 111 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  36.49 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  37.93 
 
 		 111 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  37.93 
 
 		 112 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  31.08 
 
 		 587 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  36.47 
 
 		 111 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  38.96 
 
 		 99 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  38.96 
 
 		 99 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  28.75 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 104 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 104 aa  43.9  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  26.55 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  28.99 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 285 aa  43.5  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  34.85 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  36.62 
 
 		 282 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2604  hypothetical protein  23.74 
 
 		 211 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.116763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  30.88 
 
 		 224 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  37.31 
 
 		 113 aa  42.7  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1345  hypothetical protein  25.76 
 
 		 199 aa  42.7  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4822  hypothetical protein  30.99 
 
 		 367 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>