48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0239 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  100 
 
 
143 aa  300  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  34.09 
 
 
221 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  38.36 
 
 
299 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  44.68 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  41.82 
 
 
234 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  48 
 
 
282 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  35.9 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  35.9 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  45.28 
 
 
168 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  38.98 
 
 
321 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  47.17 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  40 
 
 
218 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  43.1 
 
 
170 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  40 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  40.43 
 
 
119 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  40 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  35.37 
 
 
408 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  40.68 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  48.57 
 
 
177 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  36.07 
 
 
240 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  40.43 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  35.9 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  33.33 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  39.68 
 
 
571 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  38.3 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  41.51 
 
 
171 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  29.59 
 
 
170 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  36.51 
 
 
240 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  35.59 
 
 
178 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  39.62 
 
 
174 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  36.76 
 
 
471 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  36.76 
 
 
471 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  35.82 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  40.48 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  38.64 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  38.64 
 
 
459 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  35.21 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4463  HNH endonuclease  29.58 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  39.29 
 
 
189 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  36.36 
 
 
186 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  36.21 
 
 
309 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  41.51 
 
 
197 aa  40.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  41.51 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  40.48 
 
 
438 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4334  HNH endonuclease  44.44 
 
 
452 aa  40.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.069794  normal  0.702083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  37.5 
 
 
189 aa  40.4  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  41.07 
 
 
187 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3648  hypothetical protein  51.85 
 
 
334 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>