42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4297 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  100 
 
 		 237 aa  495  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  38.67 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  39.66 
 
 		 226 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  52.44 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  47.19 
 
 		 282 aa  95.1  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 84 aa  85.9  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  46.32 
 
 		 220 aa  85.5  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  47.5 
 
 		 116 aa  82.4  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  45.56 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  34.58 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  44.94 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  55 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  35.05 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 323 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  35.64 
 
 		 348 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0002  hypothetical protein  34.81 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1210  hypothetical protein  30.26 
 
 		 395 aa  65.5  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  45.28 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4566  hypothetical protein  28.96 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3496  hypothetical protein  32.89 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.260153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3808  hypothetical protein  32.89 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1999  hypothetical protein  30.41 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.214007  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2835  hypothetical protein  29.53 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.868461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 395 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2083  hypothetical protein  30.07 
 
 		 278 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.064212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0150  HNH endonuclease  28.71 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.550469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  37.68 
 
 		 419 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 282 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  33.87 
 
 		 309 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  27.64 
 
 		 268 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 177 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  41.38 
 
 		 295 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  27.17 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 408 aa  42.4  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  30.3 
 
 		 119 aa  42.4  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  36.84 
 
 		 549 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  40.38 
 
 		 568 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  33.78 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>