34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2497 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  100 
 
 		 309 aa  634    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  56.06 
 
 		 282 aa  85.9  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  29.89 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  32.65 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  50.79 
 
 		 84 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  34.56 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  33.61 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  36.56 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  29.38 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  41.49 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  36.19 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  43.21 
 
 		 116 aa  70.9  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  32.41 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  39.24 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  43.33 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  34.83 
 
 		 348 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  45.28 
 
 		 234 aa  50.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4957  hypothetical protein  23.08 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  35.71 
 
 		 323 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  27.47 
 
 		 367 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  42.42 
 
 		 419 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  30.34 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  28.18 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  30.11 
 
 		 267 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  40 
 
 		 387 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 422 aa  46.2  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 408 aa  46.2  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 436 aa  45.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  32.61 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>