18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3259 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3259  HNH endonuclease  100 
 
 		 128 aa  266  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298488 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 221 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  33.78 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  32.35 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  29.52 
 
 		 240 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  45.45 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  32.69 
 
 		 330 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  33.33 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  27.18 
 
 		 168 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  31.94 
 
 		 395 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  28.87 
 
 		 174 aa  41.2  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  26.21 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  32.65 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>