58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2604 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  100 
 
 
116 aa  239  7.999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  75 
 
 
116 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  74.14 
 
 
116 aa  184  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  51.3 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  43.1 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  43.1 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  41.53 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  55.71 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  48.05 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  37.29 
 
 
119 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  38.89 
 
 
115 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  37.93 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  34.92 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  33.62 
 
 
118 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3802  HNH endonuclease  32.17 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4314  HNH endonuclease  32.17 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0932405  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3875  HNH endonuclease  32.17 
 
 
119 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126583  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  31.9 
 
 
119 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  38.02 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  35.54 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  46.97 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  31.03 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  37.25 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  31.62 
 
 
119 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  33.33 
 
 
117 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  37.25 
 
 
105 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  39.19 
 
 
174 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  52.27 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  42.37 
 
 
253 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  40.32 
 
 
585 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  30.47 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  34.75 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  40.68 
 
 
81 aa  47.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  38.1 
 
 
282 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3259  HNH endonuclease  33.78 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00298488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  40.54 
 
 
112 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  40 
 
 
240 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  38.96 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  38.96 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  42.42 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  41.56 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  44.07 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  44.07 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  36.78 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  39.29 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  35.29 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  36.71 
 
 
130 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  40 
 
 
109 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  29.7 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  40.98 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  30.43 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  38.46 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  35.09 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  35.09 
 
 
185 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  40 
 
 
131 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  34.62 
 
 
386 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  32.1 
 
 
395 aa  40  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  37.5 
 
 
132 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>