64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0869 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  100 
 
 
116 aa  241  3.9999999999999997e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  64.35 
 
 
116 aa  160  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  40.62 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  40.22 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  42.53 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  34.29 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  34.48 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  40.54 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  43.48 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  39.47 
 
 
126 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  32.71 
 
 
120 aa  57  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  31.03 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  36.14 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  36.14 
 
 
89 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  34.21 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  34.15 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  37.84 
 
 
89 aa  53.9  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  34.18 
 
 
115 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  32.53 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  32.58 
 
 
124 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  37.8 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  30.09 
 
 
118 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  29.41 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  42.11 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08210  HNH endonuclease  36 
 
 
97 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00377503  hitchhiker  0.00349678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  29.55 
 
 
119 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  34.07 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  42.17 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  42.17 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  34.07 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  39.39 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  32.05 
 
 
119 aa  49.7  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  36.62 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  35.37 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0017  HNH endonuclease domain protein  35.96 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  34.02 
 
 
178 aa  47  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3540  HNH endonuclease  24.51 
 
 
163 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  33.33 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  29.89 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  32.89 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  29.11 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  33.33 
 
 
131 aa  43.5  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0644  HNH endonuclease  33.75 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0288065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  36.51 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  24.58 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  34.78 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  33.33 
 
 
253 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  33.33 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  25.24 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  37.33 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  33.8 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  35.82 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  38.46 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  34.21 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  33.8 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  34.21 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  29.7 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  31.25 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1857  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  36.9 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  27.85 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  27.85 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  32.88 
 
 
299 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  34.57 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  38.57 
 
 
112 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>