44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1967 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  207  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  48 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 174 aa  62  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  42.03 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  32.53 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  32.53 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  41.27 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  39.71 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  39.39 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  38.71 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  35.21 
 
 		 106 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  41.56 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  51.06 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  36 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 119 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  37.66 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  35.48 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  41.54 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  41.43 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  36.11 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  38.57 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  34.29 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  37.84 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  32.86 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  32.39 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  27.27 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  27.27 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  34.94 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  38.24 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  33.78 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>