77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1660 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  100 
 
 		 131 aa  259  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  49.15 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  44.72 
 
 		 119 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  45.45 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  45.45 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  46.61 
 
 		 116 aa  87  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  46.96 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  64.18 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  42.28 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  43.8 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  41.18 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  40.5 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  41.53 
 
 		 116 aa  80.5  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  33.91 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  41.6 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  49.38 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  46.51 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  39.17 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  38.17 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  34.07 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  43.09 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  47.22 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  50 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  39.76 
 
 		 129 aa  57  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  28 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  35.4 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  41.03 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  39.51 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  37.08 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  40.91 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  29.41 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  41.18 
 
 		 143 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  44.12 
 
 		 131 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  38.27 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  36.78 
 
 		 174 aa  50.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  42.25 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  36.76 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  50 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  36.9 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  49.15 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  30.85 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  48.89 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  41.56 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  34.18 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  46.81 
 
 		 427 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  35.8 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 552 aa  44.3  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  38.46 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 282 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  35.48 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  37.04 
 
 		 185 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  37.1 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  35.48 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  36.9 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  51.43 
 
 		 395 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 81 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  40.38 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  42 
 
 		 459 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  37.63 
 
 		 620 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2450  HNH endonuclease  30.91 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.156299 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  42 
 
 		 459 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  31.03 
 
 		 276 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  33.87 
 
 		 187 aa  40  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  31.03 
 
 		 278 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>