64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0466 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  100 
 
 		 148 aa  311  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  46.74 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  44.44 
 
 		 109 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  47.56 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  34.35 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  47.95 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 112 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  41.18 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  41.24 
 
 		 100 aa  78.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  41.86 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  45.24 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  46.27 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  35.56 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  40.43 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  51.61 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  40.91 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  41.46 
 
 		 118 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  33.61 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  36.15 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  45.98 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  56 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  45.07 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  41.67 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  37.21 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  33.08 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  40 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  44.26 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  39.29 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  39.29 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  45 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  45 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  28.06 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  40.91 
 
 		 299 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  32.31 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 299 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  31.54 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  37.65 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  36.62 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  32.28 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  32.28 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  30.15 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  30.47 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  33.86 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  34.88 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  35.8 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  34.69 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  27.27 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  40.35 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  37.8 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  34.52 
 
 		 120 aa  43.9  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  28.68 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  34.29 
 
 		 138 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  28.32 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  28.35 
 
 		 119 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  32.39 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  30.08 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 253 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>