43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3405 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  100 
 
 		 107 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  52.81 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  49.48 
 
 		 145 aa  97.1  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  48.98 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  48.98 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  50.56 
 
 		 106 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  48.31 
 
 		 109 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  51.95 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  39.47 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  44.66 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  49.3 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  48.68 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  45.88 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  47.83 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  49.3 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  45.88 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  48.48 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  51.47 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  49.32 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  51.52 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  49.28 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  40 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  47.22 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  42.67 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  43.55 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  39.53 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  42.03 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  42.31 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  42.42 
 
 		 148 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  43.33 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  46.81 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  37.14 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  37.33 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  44 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  34.94 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  37.31 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>