54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1362 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  79.28 
 
 		 119 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  62.28 
 
 		 116 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  55.86 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  56.76 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  51.82 
 
 		 113 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  53.45 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  46 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  53.95 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  46 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  42.02 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  50.62 
 
 		 109 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  49.37 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  49.38 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  45.35 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  48.68 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  43.88 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  46.08 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  41.46 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  52.31 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  40.91 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  39.22 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  39.22 
 
 		 117 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  38.24 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  49.32 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  35.29 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  40 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  34.86 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  36.08 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  34.82 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  44.78 
 
 		 299 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  44.78 
 
 		 299 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  47.14 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  47.14 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  30.09 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  34.88 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  40 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  35.06 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  35.06 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  33.93 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  30.61 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  32.76 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  34.19 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  32.2 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 89 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  27.87 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>