44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5470 on replicon NC_010721
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  224  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  56.76 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  55.36 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  54.05 
 
 		 116 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  52.25 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  46.67 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  36.61 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  47.3 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  36.59 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  44.59 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  41.35 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  37.14 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  37.14 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  34.17 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  38.32 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  47.14 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  38.75 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  43.75 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  36.19 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  36.84 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  43.42 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  36.08 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  40.74 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  33.33 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  35.11 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  35.11 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  37.82 
 
 		 146 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  37.23 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  26.09 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  27.93 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  34.78 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  37.23 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  50 
 
 		 299 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  47.37 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  31.08 
 
 		 134 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  46.81 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  38.16 
 
 		 138 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  32.32 
 
 		 112 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 119 aa  40  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>