45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1748 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  60.17 
 
 		 299 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  58.47 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  58.47 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  58.82 
 
 		 299 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  53.78 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  49.43 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  47.73 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  47.73 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  47.95 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  45.21 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  39.29 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  47.22 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  33.85 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  43.75 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  38.66 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  41.18 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  65.79 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  39.09 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  34.88 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  41.98 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  59.52 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  43.06 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  58.97 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  32.5 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  31.87 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  51.28 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  51.35 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  41.1 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  46.81 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  34.29 
 
 		 148 aa  42.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  38.38 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  33.33 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  35.44 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  34.78 
 
 		 127 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  38.16 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  34.33 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  36.47 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  47.62 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  42.86 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>