18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2486 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  100 
 
 		 111 aa  229  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  56.25 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  55.36 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  54.46 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  52.25 
 
 		 120 aa  119  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  49.47 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  47.47 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  46 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  41.23 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  38.94 
 
 		 116 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  36.61 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  40.79 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  36.75 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  35.8 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  36.59 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  24.58 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  31.65 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>