56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0279 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  100 
 
 
119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  79.28 
 
 
118 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  63.06 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  54.05 
 
 
120 aa  125  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  55.36 
 
 
113 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  53.39 
 
 
115 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  45.98 
 
 
128 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  42.02 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  43.56 
 
 
125 aa  80.1  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  44.71 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  51.43 
 
 
106 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  41.23 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  55.38 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  46.84 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  38.28 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  40.16 
 
 
120 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  42.57 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  44.57 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  42.57 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  40.43 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  48 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  44.3 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  45.45 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  41.58 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  49.3 
 
 
107 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  43.42 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  51.43 
 
 
299 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  43.14 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  51.43 
 
 
299 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  40.59 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  34.48 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  38.28 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  45.71 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  38.14 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  45.71 
 
 
116 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  31.48 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  43.06 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  39.09 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  31.68 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  51.06 
 
 
160 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  33.94 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  38.05 
 
 
119 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  36.28 
 
 
119 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  36.28 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  39.51 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  31.53 
 
 
118 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  38.37 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  40.98 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  34.48 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  36.05 
 
 
89 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  36.05 
 
 
89 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  36.25 
 
 
113 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  27.61 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>