18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2023 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2023  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163439  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0335  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  99.15 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.124019  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1722  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  93.97 
 
 		 116 aa  224  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.500096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  55.36 
 
 		 111 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  48.42 
 
 		 115 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  41.18 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  42.57 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  40.59 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  38.94 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0864  Restriction endonuclease protein  41.9 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  37.14 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  33.87 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  37.8 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  32.58 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  28.07 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08210  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00377503  hitchhiker  0.00349678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  31.08 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>