49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4460 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  100 
 
 		 125 aa  264  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  55.93 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  47.22 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  43.24 
 
 		 106 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  42.39 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  43.56 
 
 		 119 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  46.07 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 107 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  41.49 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  43.88 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  46.59 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  40.57 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  37.62 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  42 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  38.32 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  38.32 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  45.21 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  37.25 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  40.24 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  41.67 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  42.35 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  33.03 
 
 		 132 aa  57  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  38.27 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  32.95 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  34.67 
 
 		 118 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  32.67 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  38.24 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  30.85 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  35.92 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  34.65 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  39.39 
 
 		 299 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  31.3 
 
 		 112 aa  43.9  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  37.04 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  47.5 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  35.19 
 
 		 119 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  35.09 
 
 		 115 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  41.54 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  34.88 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  34.88 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  39.13 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 299 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>