37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1042 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1042  59R  100 
 
 
112 aa  230  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  81.73 
 
 
129 aa  178  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  43.4 
 
 
129 aa  81.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  42.16 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  45.88 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  35.78 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  36.54 
 
 
109 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  40.59 
 
 
119 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  35.29 
 
 
118 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  39.18 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  39.33 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  34.69 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  36 
 
 
124 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  35.42 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  34.29 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  33.67 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  32.29 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  58.97 
 
 
299 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  59.52 
 
 
138 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  34.62 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  52.5 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  58.97 
 
 
299 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  45.45 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  45.45 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  34.88 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  29.25 
 
 
128 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  34.23 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  34.48 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  55 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  55 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  31.3 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  41.82 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  44.23 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  35.71 
 
 
115 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  34.09 
 
 
131 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  32.58 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  31.63 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>