45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4278 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  244  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  78.15 
 
 		 145 aa  199  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  48.98 
 
 		 107 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  46.24 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  39.45 
 
 		 112 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  45.1 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  37.04 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  43.69 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  49.41 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  49.41 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  49.3 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  40.43 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 299 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  47.73 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  47.56 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  42.53 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  38.32 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  43.24 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  46.75 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  44.62 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  39.13 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  48.48 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  36.9 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  41.03 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  39.29 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  42.42 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  36.46 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  35.06 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  50.94 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  35.11 
 
 		 113 aa  48.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  30.11 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  55 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  30.49 
 
 		 174 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  35.21 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1299  hypothetical protein  35.37 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  35.29 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  40 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  30.3 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  27.85 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  37.33 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>