33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0235 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  240  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  53.78 
 
 
138 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  45.61 
 
 
299 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  45.61 
 
 
299 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  61.63 
 
 
116 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  61.63 
 
 
116 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  46.24 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  46.24 
 
 
120 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  50.6 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  38.67 
 
 
113 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  42.86 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  30.43 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  42.31 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  42.86 
 
 
109 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  42.86 
 
 
112 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  38.2 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  44.29 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  34.48 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  33.62 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  39.06 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1299  hypothetical protein  37.97 
 
 
81 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  35.71 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  35.71 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  27.84 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  37.14 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  42.25 
 
 
143 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  28.87 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  41.82 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  36.36 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  29.55 
 
 
127 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  27.08 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  25.27 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  27.08 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>