68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3948 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  100 
 
 		 112 aa  234  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  51.82 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  51.16 
 
 		 109 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  51.16 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  46.74 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  61.43 
 
 		 129 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  54.32 
 
 		 106 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  53.26 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  51.9 
 
 		 124 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  52.81 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  42.74 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  50.67 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  52.63 
 
 		 113 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  51.35 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  54.29 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  53.52 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  53.33 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  42.86 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  44.71 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  49.37 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  48 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  42.16 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  44.3 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  49.3 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  49.3 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  46.67 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  49.3 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 116 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  40.35 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  39.47 
 
 		 299 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  46.34 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  59.26 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  43.94 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  38.66 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  41.67 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  43.94 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  38.38 
 
 		 111 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  42.86 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  37.8 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  39.13 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  46.97 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  42.31 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  33.8 
 
 		 119 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  36.23 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2486  HNH endonuclease  40.79 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  41.38 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  33.8 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 253 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  39.73 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  40.54 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  37.21 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  31.17 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  31.88 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  34.18 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  32.91 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  34.85 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>