50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1992 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  300  6.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  78.15 
 
 
120 aa  199  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  78.15 
 
 
120 aa  199  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  49.48 
 
 
107 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  44.57 
 
 
112 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  43.48 
 
 
109 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  47.25 
 
 
106 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  50.6 
 
 
114 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  53.52 
 
 
112 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  50.59 
 
 
116 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  50.59 
 
 
116 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  51.22 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  50 
 
 
299 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  39.22 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  49.43 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  39.25 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  38.17 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  40.57 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  42.86 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  40.82 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  51.56 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  36.59 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  45.45 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  33.33 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  38.3 
 
 
113 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  46.97 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  44.26 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  42.53 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  35.56 
 
 
132 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  43.06 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  40.85 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  42.03 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  37.68 
 
 
100 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  30.43 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  36.36 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  52.5 
 
 
112 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  51.06 
 
 
160 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  31.65 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  33.78 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  33.33 
 
 
174 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  29.11 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  25 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1299  hypothetical protein  37.8 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  34.12 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  35.48 
 
 
117 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  34.38 
 
 
127 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  40.68 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  33.78 
 
 
99 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  48.84 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  36.84 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>