38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3313 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  100 
 
 
299 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  94.28 
 
 
299 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  58.82 
 
 
138 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  51.75 
 
 
116 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  51.75 
 
 
116 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0235  hypothetical protein  45.61 
 
 
114 aa  107  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  33.84 
 
 
253 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  46.34 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  46.34 
 
 
120 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  47.37 
 
 
107 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  46.05 
 
 
126 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  39.47 
 
 
112 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  51.43 
 
 
116 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  51.43 
 
 
119 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  44.94 
 
 
129 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  44.93 
 
 
112 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  44.12 
 
 
109 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  45.07 
 
 
113 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  46.05 
 
 
120 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  42.31 
 
 
113 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1844  HNH endonuclease  41.54 
 
 
178 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  44.78 
 
 
118 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  39.56 
 
 
106 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  39.19 
 
 
131 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  42.42 
 
 
148 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  42.62 
 
 
124 aa  50.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  41.27 
 
 
129 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1652  restriction endonuclease  37.5 
 
 
146 aa  50.4  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  45 
 
 
115 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  58.97 
 
 
112 aa  50.4  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  43.33 
 
 
128 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  56.41 
 
 
160 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  34.67 
 
 
89 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  50 
 
 
112 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  34.67 
 
 
89 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  34.67 
 
 
89 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1857  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  33.77 
 
 
119 aa  43.5  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>