53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5153 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  100 
 
 		 132 aa  272  9e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  65.62 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  42.27 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 99 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  37.93 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  39.22 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  37.76 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  55.56 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  33.03 
 
 		 125 aa  57  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  37.78 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  37.78 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  35.29 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  42.42 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  35.56 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  42.03 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  42.62 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  42.19 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  39.39 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  40.54 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  42.19 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  40.51 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  33.73 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  43.08 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  40.85 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  38.24 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  31.68 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  40.51 
 
 		 253 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  38.64 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  33.78 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  34.38 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  39.19 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  38.36 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2609  phage related protein  35.14 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  40.3 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  39.68 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  34.21 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  31.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  34.88 
 
 		 116 aa  42  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  32.53 
 
 		 115 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  34.29 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  34.67 
 
 		 120 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  37.68 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  34.12 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 116 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  36.84 
 
 		 116 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>