39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1548 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  265  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  50.96 
 
 
143 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  43.48 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  45.98 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  49.41 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  48 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  47.22 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  45.68 
 
 
116 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  41.57 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  49.28 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  57.63 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  50.7 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  37.62 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  40.91 
 
 
118 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  39.51 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  47.54 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  43.06 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  41.05 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  45.07 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  38.89 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3982  HNH endonuclease  45.98 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5470  hypothetical protein  44.16 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  40 
 
 
107 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  42.53 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  41.03 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  41.03 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  31.11 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  41.27 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  48.94 
 
 
160 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3862  hypothetical protein  31.73 
 
 
129 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319017 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  45 
 
 
299 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  43.33 
 
 
299 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1042  59R  29.25 
 
 
112 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143051  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  43.59 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  42.86 
 
 
131 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  46.67 
 
 
135 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  42.86 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  43.14 
 
 
116 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  43.14 
 
 
116 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>