38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2691 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  48.33 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  48.33 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  33.33 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  39.73 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  43.94 
 
 		 112 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  38.96 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  40 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2355  HNH nuclease / phage phi-105 holin-like protein  35.29 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.206225  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0279  HNH endonuclease  31.68 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  31.11 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  32.95 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1480  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  40.51 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  39.44 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  43.1 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6179  prophage LambdaSo holin  34.88 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1892  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.989939  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  38.03 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  51.06 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  33.73 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  53.33 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1362  HNH endonuclease  30.61 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.858411  normal  0.39996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  36.11 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  36.76 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1992  hypothetical protein  33.78 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538267  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  40.35 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  40 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  34.78 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2617  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4278  hypothetical protein  35.29 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3405  HNH endonuclease  37.31 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  38.6 
 
 		 127 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 131 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>