72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1641 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  100 
 
 		 119 aa  249  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  68.07 
 
 		 119 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  67.23 
 
 		 119 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  68.38 
 
 		 119 aa  177  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  66.95 
 
 		 118 aa  169  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  61.74 
 
 		 115 aa  155  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  48.36 
 
 		 126 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  37.39 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  36.72 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  35.04 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  38.46 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  35.9 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  35.04 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  36.97 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  35.65 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  36.52 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  35.58 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  36.44 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  41.86 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  30.23 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  31.03 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  41.1 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  41.27 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  38.96 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  31.58 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  31.67 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 253 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  32.67 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1339  hypothetical protein  43.08 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2691  hypothetical protein  34.72 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.824907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  38.82 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  38.82 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  44.07 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  45.83 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  36.25 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  32.86 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  32.86 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  43.64 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  36.84 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  28.92 
 
 		 240 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 277 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1614  HNH endonuclease  31.46 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.976423  normal  0.336979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1548  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  50 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0527  HNH endonuclease  43.4 
 
 		 365 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.991907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  38.3 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  36.92 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  30.3 
 
 		 237 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3897  HNH endonuclease  37.04 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  36.49 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  25.77 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  28.35 
 
 		 148 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1455  hypothetical protein  31.03 
 
 		 116 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.848536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  38.18 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  58.62 
 
 		 585 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  29.21 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  33.87 
 
 		 387 aa  40.4  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  45 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>