68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1627 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  100 
 
 
253 aa  521  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  33.84 
 
 
299 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2072  putative Phage-related holin protein  33.33 
 
 
299 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  47.22 
 
 
131 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  53.7 
 
 
116 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  55.56 
 
 
101 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  39.44 
 
 
119 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  41.54 
 
 
119 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  51.85 
 
 
116 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  41.38 
 
 
118 aa  55.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  38.03 
 
 
119 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  44.26 
 
 
174 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  43.1 
 
 
119 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  41.1 
 
 
122 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  42.67 
 
 
124 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  39.73 
 
 
122 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  36.25 
 
 
112 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  44.44 
 
 
116 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  40.54 
 
 
111 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  38.33 
 
 
115 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4063  HNH endonuclease  32.53 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.629789  normal  0.501923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  42.31 
 
 
129 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  40.51 
 
 
132 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  34.57 
 
 
126 aa  47  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  39.34 
 
 
125 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  36.84 
 
 
116 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  40.68 
 
 
118 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  34.33 
 
 
81 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  38.46 
 
 
560 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  48.78 
 
 
81 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  30.12 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  39.13 
 
 
146 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1967  hypothetical protein  35.06 
 
 
99 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  29.73 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  39.66 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  31.08 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  39.66 
 
 
165 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1436  HNH nuclease  32.05 
 
 
164 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.725628  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  31.94 
 
 
184 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  31.94 
 
 
184 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  29.73 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  29.73 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  48 
 
 
80 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  37.29 
 
 
178 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  40 
 
 
187 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  48 
 
 
80 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  37.5 
 
 
131 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  32.1 
 
 
191 aa  43.5  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  33.33 
 
 
116 aa  43.5  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  37.78 
 
 
167 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  34.72 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  31.25 
 
 
178 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  32.53 
 
 
197 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3609  HNH endonuclease  30.12 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3614  HNH endonuclease  30.12 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  29.58 
 
 
194 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3682  HNH endonuclease  30.12 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  37.1 
 
 
198 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1652  hypothetical protein  43.64 
 
 
160 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  31.43 
 
 
222 aa  42.7  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  37.1 
 
 
198 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  38.81 
 
 
133 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  32.43 
 
 
177 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  36.21 
 
 
168 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  38.64 
 
 
189 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  35.44 
 
 
99 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  34.48 
 
 
174 aa  42.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  40.98 
 
 
126 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>