62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2488 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  100 
 
 		 277 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  51.35 
 
 		 330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  49.57 
 
 		 226 aa  122  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  50.43 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  52.44 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1765  HNH endonuclease  42.61 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  58.67 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  51.76 
 
 		 220 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0601  HNH endonuclease  56.34 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700126  normal  0.014052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0919  HNH endonuclease  42.27 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2792  HNH endonuclease  35.16 
 
 		 233 aa  89.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00169  HNH nuclease  53.16 
 
 		 116 aa  85.5  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  32.8 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4584  HNH endonuclease  44.59 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.386602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1083  HNH endonuclease  41.89 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0692157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6329  HNH endonuclease typeIV restriction enzyme  39 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523824  hitchhiker  0.00205362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4628  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  36.44 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  28.18 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4026  hypothetical protein  37.74 
 
 		 122 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.477037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  35.05 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 387 aa  49.3  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  59.38 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 388 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3203  hypothetical protein  35.38 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000490402  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2123  hypothetical protein  37.1 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203895  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  32.32 
 
 		 224 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2573  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 220 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.468834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  35.37 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  32.14 
 
 		 515 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  28.92 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  27.1 
 
 		 367 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  42.55 
 
 		 118 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  53.12 
 
 		 549 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2534  HNH endonuclease  31.76 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 119 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7830  hypothetical protein  37.31 
 
 		 419 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  36.51 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 119 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  34.78 
 
 		 96 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  32.76 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  34.85 
 
 		 174 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  35.19 
 
 		 115 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3106  hypothetical protein  32.1 
 
 		 106 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053259  normal  0.167409 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12494  hypothetical protein  36.36 
 
 		 222 aa  43.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.255519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  25.9 
 
 		 177 aa  43.1  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 163 aa  43.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  27.97 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  37.35 
 
 		 443 aa  42.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 321 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  33.71 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  32.79 
 
 		 81 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  33.71 
 
 		 211 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0354  HNH nuclease  27.97 
 
 		 340 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1114  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 92 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  39.58 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.93 
 
 		 596 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  46.88 
 
 		 200 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  33.87 
 
 		 146 aa  42.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  34.85 
 
 		 168 aa  42.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>