114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1677 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  100 
 
 		 118 aa  241  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0545  gp82  90.91 
 
 		 79 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.719132  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  54.24 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  53.39 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  51.3 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  49.15 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  43.59 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  37.39 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  41.88 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  39.81 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  38.26 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  34.51 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  54.17 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  36.36 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1680  phage phi-105 holin-like protein  37.7 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.376636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1731  HNH endonuclease  35.77 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  31.45 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7134  HNH endonuclease  37.61 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.212331  hitchhiker  0.0000400861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0955  HNH endonuclease family protein  42.37 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  45.33 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4388  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4248  HNH endonuclease  41.77 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  40 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 282 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  32.26 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3975  HNH endonuclease  35.4 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0390575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  52.08 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  43.1 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  31.03 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3802  HNH endonuclease  31.93 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3875  HNH endonuclease  31.93 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4314  HNH endonuclease  31.93 
 
 		 119 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0932405  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0538  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.218347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2241  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3948  HNH endonuclease  39.73 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4460  Gp74  38.24 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000225902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 395 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  37.93 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  40.68 
 
 		 253 aa  46.2  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  39.74 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  29.66 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  40.26 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  35.8 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  35.8 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  30.09 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 552 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  30.09 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  39.66 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  36.21 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  35 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  33.65 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  39.66 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  41.38 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  39.66 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  48.28 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  32.18 
 
 		 459 aa  44.7  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  33.93 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  40.26 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  27.5 
 
 		 171 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  37.18 
 
 		 172 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  41.1 
 
 		 587 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3883  phage holin, putative  39.13 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334094 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0466  phage holin protein  28.68 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.351052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  31.03 
 
 		 459 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  37.93 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  31.36 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2969  prophage LambdaSo, holin, putative  40.91 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  32.05 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 635 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2249  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2895  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896232 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2598  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0728832  normal  0.0292446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  32.76 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  43.1 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  27.59 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  32.76 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  29.63 
 
 		 635 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  39.39 
 
 		 131 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0668  HNH endonuclease  35.8 
 
 		 174 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 197 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 168 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  35.62 
 
 		 560 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 180 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  31.03 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  32.05 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0868  HNH endonuclease  41.82 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0479287  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  37.29 
 
 		 178 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  41.38 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  29.41 
 
 		 213 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>