163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4118 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  100 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  54.05 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  54.05 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  53.03 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  51.52 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  50.72 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  50.79 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  45.57 
 
 		 163 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1241  HNH endonuclease  45.71 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000698354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  50.85 
 
 		 552 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 80 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1627  HNH endonuclease  46.38 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.543288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1660  HNH endonuclease  48.61 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  45.59 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  44.07 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  43.66 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0389  HNH endonuclease domain-containing protein  44.29 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  40 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2845  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 119 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00270614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4626  HNH endonuclease  40 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  42.86 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  43.55 
 
 		 240 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  40.98 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2895  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000896232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2249  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000074902 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  37.14 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  41.54 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1473  HNH endonuclease domain-containing protein  37.7 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.1152  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3802  HNH endonuclease  42.65 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3875  HNH endonuclease  42.65 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4314  HNH endonuclease  42.65 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0932405  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  46.03 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  37.7 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.8 
 
 		 596 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  40 
 
 		 170 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  29.07 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.44 
 
 		 607 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.44 
 
 		 607 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.44 
 
 		 607 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.44 
 
 		 607 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  46 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  33.33 
 
 		 174 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.97 
 
 		 661 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1893  HNH endonuclease domain protein  38.18 
 
 		 435 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  36.76 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  35 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  40 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  35 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.67 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 165 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  44.23 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  35 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5292  hypothetical protein  37.04 
 
 		 178 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  42.86 
 
 		 218 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  38.81 
 
 		 387 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  35 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  36.36 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1857  prophage LambdaSa2, HNH endonuclease family protein  36.76 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  36.67 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0869  HNH endonuclease domain protein  37.7 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000558985  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  34.43 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  36.84 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 168 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 213 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  40.38 
 
 		 185 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 191 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 		 189 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2241  HNH endonuclease  31.43 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  40.38 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 196 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  35.09 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3313  HNH endonuclease  32.14 
 
 		 299 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.237766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  33.33 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  33.33 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.5 
 
 		 648 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  34.92 
 
 		 278 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.5 
 
 		 648 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 177 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  34.92 
 
 		 276 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>