20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3802 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3802  HNH endonuclease  100 
 
 
119 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4314  HNH endonuclease  100 
 
 
119 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0932405  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3875  HNH endonuclease  100 
 
 
119 aa  242  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126583  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2604  HNH endonuclease  32.17 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  35.71 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  34.82 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  31.93 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  38.6 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  31.97 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2519  hypothetical protein  43.64 
 
 
108 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  47.37 
 
 
101 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1333  HNH endonuclease  33.05 
 
 
122 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.212728 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  30.26 
 
 
174 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  39.06 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2414  HNH endonuclease  41.27 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215443  hitchhiker  0.00417831 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  29.52 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  33.8 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  33.8 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  33.33 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  29.35 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>