26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2895 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2895  HNH endonuclease  100 
 
 
121 aa  246  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000896232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2249  HNH endonuclease  100 
 
 
121 aa  246  8e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000074902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2241  HNH endonuclease  65.69 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.40333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  37.5 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  37.93 
 
 
81 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6248  putative class I holin  31.37 
 
 
126 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0694977  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  35.71 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  35.71 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  28.57 
 
 
174 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  45.1 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  41.67 
 
 
194 aa  43.9  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  37.29 
 
 
230 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1902  restriction endonuclease  40 
 
 
1187 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.870931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1129  HNH endonuclease  42.86 
 
 
271 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497129  unclonable  0.00000789585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4601  RNA-directed DNA polymerase  32 
 
 
585 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1677  gp70  38.03 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  35.06 
 
 
585 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  40.35 
 
 
167 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  30.67 
 
 
363 aa  41.6  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  35.9 
 
 
560 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2269  HnhC  35.14 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180457  normal  0.139619 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  36.71 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  29.25 
 
 
228 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  31.07 
 
 
213 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2273  HNH endonuclease  35.71 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0446972  hitchhiker  0.0000000000000086508 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  30.86 
 
 
174 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>