148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0579 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  100 
 
 
123 aa  256  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  45.07 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  49.06 
 
 
166 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  35.63 
 
 
177 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  43.14 
 
 
321 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  37.88 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  46.81 
 
 
169 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  39.62 
 
 
167 aa  50.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  43.75 
 
 
186 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  33.33 
 
 
560 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  52.17 
 
 
218 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  51.92 
 
 
359 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  42.11 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1499  HNH endonuclease  30.36 
 
 
427 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000016403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  39.62 
 
 
169 aa  48.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  35.85 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  48.08 
 
 
368 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  39.71 
 
 
174 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  52.38 
 
 
234 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  48.08 
 
 
370 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  48.08 
 
 
356 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  50 
 
 
334 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  28.95 
 
 
228 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  50 
 
 
373 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  50 
 
 
361 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  48.08 
 
 
370 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  50 
 
 
362 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  41.67 
 
 
188 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2426  HNH endonuclease  40 
 
 
443 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  35.14 
 
 
230 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  41.94 
 
 
309 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  33.33 
 
 
240 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  33.85 
 
 
185 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  39.58 
 
 
420 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  29.13 
 
 
188 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  48.08 
 
 
179 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  38.33 
 
 
232 aa  46.2  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0189  hypothetical protein  34.25 
 
 
585 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0774  normal  0.215146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  48.08 
 
 
355 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  27.64 
 
 
216 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  48.08 
 
 
416 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  45.1 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  48.08 
 
 
346 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  45.1 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  48.08 
 
 
370 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  48.08 
 
 
358 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  39.29 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  50 
 
 
368 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  48.08 
 
 
357 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  24.39 
 
 
194 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  37.88 
 
 
167 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  37.93 
 
 
309 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  35.19 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0004  HNH nuclease  35 
 
 
255 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  48.08 
 
 
382 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  46.15 
 
 
357 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  41.07 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1951  HNH endonuclease  46.81 
 
 
1138 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  36.49 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0007  HNH endonuclease  41.51 
 
 
162 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  46.15 
 
 
392 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  37.1 
 
 
387 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  48.08 
 
 
357 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  37.1 
 
 
388 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  38.6 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  48.08 
 
 
362 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  36.76 
 
 
842 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  46 
 
 
322 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  38.24 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  40 
 
 
169 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  35.29 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0558  HNH endonuclease  30.34 
 
 
185 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  41.67 
 
 
188 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  35.29 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  38.89 
 
 
170 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1718  Gp60  47.92 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.136021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35.19 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  48.08 
 
 
407 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  38.98 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  28.09 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  33.96 
 
 
189 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  39.29 
 
 
189 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  30 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0684  HNH endonuclease  32.58 
 
 
199 aa  43.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0070  HNH endonuclease  31.88 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.856435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  48 
 
 
387 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  48.08 
 
 
379 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4561  HNH endonuclease  41.67 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7339  HNH endonuclease  35.48 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539168  hitchhiker  0.000174655 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  42.37 
 
 
359 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3308  HNH endonuclease  39.58 
 
 
211 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.329837  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  47.73 
 
 
282 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  46.51 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.541887 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5097  hypothetical protein  48.65 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00104603  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  38.75 
 
 
391 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  38.75 
 
 
388 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0798  HNH endonuclease  40 
 
 
438 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.32296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  33.8 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0731  HNH endonuclease  45 
 
 
246 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1365  HNH endonuclease domain protein  39.22 
 
 
471 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>