27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3167 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3167  HNH endonuclease  100 
 
 
177 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  29.92 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1094  HNH endonuclease domain-containing protein  29.23 
 
 
115 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.171371  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  38.46 
 
 
234 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  34.92 
 
 
309 aa  47  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3026  HNH endonuclease  39.06 
 
 
552 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409509  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4228  HNH endonuclease  33.33 
 
 
242 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0110599  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0017  HNH endonuclease  35 
 
 
282 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000482727  normal  0.797394 
 
 
 
NC_007492  Pfl01_4297  HNH endonuclease  34.92 
 
 
237 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.202378  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  35.14 
 
 
282 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1215  HNH nuclease  35.29 
 
 
260 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2472  HNH endonuclease  54.29 
 
 
471 aa  44.3  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.388453  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2443  HNH endonuclease  54.29 
 
 
471 aa  44.3  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4096  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  37.5 
 
 
120 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3808  prophage LambdaBa02, HNH endonuclease family protein  37.5 
 
 
120 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_5002  HNH endonuclease  36.67 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0239  HNH endonuclease  48.57 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.628589  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  33.87 
 
 
240 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3155  HNH endonuclease  39.13 
 
 
330 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000147515  unclonable  2.36676e-16 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  28.57 
 
 
299 aa  43.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  25.9 
 
 
277 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  37.04 
 
 
119 aa  43.5  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0977  HNH endonuclease  50 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.592566  hitchhiker  0.000615877 
 
 
-
 
NC_002936  DET0069  HNH endonuclease domain-containing protein  33.33 
 
 
118 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0033  hypothetical protein  24.81 
 
 
220 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000766815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02910  HNH endonuclease  34.43 
 
 
395 aa  41.6  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4118  HNH endonuclease  31.65 
 
 
101 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.541887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>