20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2505 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  100 
 
 		 107 aa  223  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2291  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1716  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1331  HNH endonuclease  36.71 
 
 		 89 aa  52.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1287  HNH endonuclease  42.67 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.267198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0654  HNH endonuclease  37.78 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1748  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5153  HNH endonuclease  31.68 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  38.64 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  35.96 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1578  HNH endonuclease  32.58 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1077  HNH endonuclease  29.76 
 
 		 104 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.687117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1057  HNH endonuclease  29.76 
 
 		 104 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.297897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1561  phage holin, putative  38.81 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250556  hitchhiker  0.000211382 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 99 aa  40  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 99 aa  40  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4975  hypothetical protein  32.93 
 
 		 134 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4680  hypothetical protein  32.93 
 
 		 134 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612737  normal  0.79747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4592  hypothetical protein  32.93 
 
 		 134 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>