24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0383 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  100 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  36.05 
 
 		 163 aa  53.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  47.89 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2505  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 107 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0119  putative type IV secretion system protein IcmJ/DotN  35.62 
 
 		 239 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2957  HNH endonuclease  43.33 
 
 		 408 aa  48.1  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0027  hypothetical protein  30.43 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2953  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 222 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.449609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 234 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  38.24 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 309 aa  43.5  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 422 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  40.32 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  40.74 
 
 		 436 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0873  HNH endonuclease  44.19 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.473329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2811  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4608  HNH endonuclease  28.12 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0017  HNH endonuclease domain protein  33.33 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1422  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 321 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0138044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2082  RNA-directed DNA polymerase  34.33 
 
 		 635 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3662  hypothetical protein  34.85 
 
 		 223 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.217409  normal  0.779139 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 388 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0879  HNH endonuclease family protein  42.59 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00646503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 387 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>