More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2082 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2082  RNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
635 aa  1320    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0089  reverse transcriptase  34.72 
 
 
632 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0077  reverse transcriptase  34.72 
 
 
632 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0589009  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1189  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  38.36 
 
 
605 aa  362  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0255712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2751  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  33.23 
 
 
618 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3857  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.87 
 
 
604 aa  291  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3691  reverse transcriptase/endonuclease  31.73 
 
 
642 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0018  group II intron reverse transcriptase/maturase  31.73 
 
 
642 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.213024 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0120  reverse transcriptase  31.73 
 
 
642 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0016  group II intron reverse transcriptase/maturase  31.73 
 
 
642 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3675  group II intron reverse transcriptase/maturase  31.73 
 
 
642 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3699  group II intron reverse transcriptase/maturase  31.73 
 
 
642 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0466  group II intron reverse transcriptase/maturase  32.21 
 
 
599 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0035  group II intron reverse transcriptase/maturase  31.69 
 
 
643 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0034  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.23 
 
 
627 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1017  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.72 
 
 
610 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0781817  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0165  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.72 
 
 
610 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.508109  hitchhiker  6.15504e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1884  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.72 
 
 
610 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.18687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1054  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.72 
 
 
610 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.200427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4056  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.72 
 
 
610 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4163  group II intron reverse transcriptase/maturase  30.72 
 
 
610 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0401261  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0013  group II intron reverse transcriptase/maturase  31.65 
 
 
599 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.631939 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5242  RNA-directed DNA polymerase  28.26 
 
 
587 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.461209  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4139  RNA-directed DNA polymerase  32.25 
 
 
488 aa  193  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4626  RNA-directed DNA polymerase  32.86 
 
 
503 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4498  RNA-directed DNA polymerase  31.85 
 
 
504 aa  189  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4556  group II intron-encoded protein LtrA  32.47 
 
 
604 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000506643  normal  0.0229072 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1762  group II intron-encoded protein LtrA  32.47 
 
 
604 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.255924  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5597  group II intron-encoded protein LtrA  32.47 
 
 
604 aa  182  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.147853  hitchhiker  0.000000000602263 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0017  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  31.88 
 
 
502 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4841  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  31.88 
 
 
502 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.266304  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0055  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  31.88 
 
 
502 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.155092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4858  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  31.88 
 
 
502 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0016  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35 
 
 
507 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.934591  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0025  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35 
 
 
507 aa  178  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.352503  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3327  group II intron-encoded reverse transcriptase/maturase  35.45 
 
 
502 aa  177  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3347  RNA-directed DNA polymerase  35.15 
 
 
381 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6987  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.96 
 
 
507 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0664  RNA-directed DNA polymerase  27.79 
 
 
605 aa  173  1e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4007  RNA-directed DNA polymerase  31.91 
 
 
483 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174227  hitchhiker  0.00583447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1921  RNA-directed DNA polymerase  29.56 
 
 
595 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1685  retron-type reverse transcriptase  31.34 
 
 
599 aa  168  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.950387  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  28.87 
 
 
566 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0253  RNA-directed DNA polymerase  30.74 
 
 
571 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C19  maturase MatR  31.11 
 
 
599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0447  RNA-directed DNA polymerase  28.75 
 
 
568 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.499499  normal  0.735233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1533  RNA-directed DNA polymerase  27.5 
 
 
607 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1235  GBSi1, group II intron, maturase  31.69 
 
 
425 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  32.35 
 
 
544 aa  164  3e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3149  RNA-directed DNA polymerase  28.9 
 
 
565 aa  165  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0475182  normal  0.0238901 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0567  prophage LambdaSa1, reverse transcriptase/maturase family protein  34.02 
 
 
439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2196  RNA-directed DNA polymerase  29.92 
 
 
633 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.035125  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3928  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.92 
 
 
633 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.105215  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0011  reverse transcriptase/endonuclease protein  28.02 
 
 
602 aa  163  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.48 
 
 
548 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13490  RNA-directed DNA polymerase  27.85 
 
 
515 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  27.89 
 
 
549 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.24 
 
 
548 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.24 
 
 
548 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.24 
 
 
548 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.24 
 
 
548 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  34.24 
 
 
548 aa  161  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2831  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.14 
 
 
469 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2838  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  161  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2375  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1618  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000636906  hitchhiker  0.000000000000550097 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0697  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1922  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1463  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1455  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.170778  normal  0.343243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1878  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.18587  normal  0.561944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0975  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  31.54 
 
 
422 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.171918  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2426  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0142  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0584  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1387  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.017267  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1820  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102915  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2067  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121404  normal  0.0104805 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0976  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.307448  normal  0.190974 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0812  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.158231  hitchhiker  0.0000219513 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2652  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2185  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0624  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2778  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1901  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1923  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1714  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  30.24 
 
 
475 aa  160  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.125991 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  34.24 
 
 
553 aa  160  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4361  RNA-directed DNA polymerase  31.18 
 
 
593 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1035  hypothetical protein  30.7 
 
 
482 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1253  hypothetical protein  30.7 
 
 
482 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2960  RNA-directed DNA polymerase  31.18 
 
 
593 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1977  hypothetical protein  30.7 
 
 
482 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07480  putative reverse transcriptase  28.7 
 
 
561 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000108992  normal  0.278112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4607  RNA-directed DNA polymerase  31.18 
 
 
593 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0483  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  29.35 
 
 
419 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000125765  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3169  RNA-directed DNA polymerase  28.23 
 
 
543 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  27.46 
 
 
569 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0382  RNA-directed DNA polymerase  27.97 
 
 
568 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>