45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2799 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2799  HNH endonuclease  100 
 
 		 309 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00129487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0677  HNH nuclease  64.17 
 
 		 309 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.872513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0490  HNH endonuclease  41.54 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 321 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  39.06 
 
 		 163 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3568  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1061  HNH endonuclease  41.94 
 
 		 436 aa  49.3  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  31.4 
 
 		 842 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  34.15 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0555  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 388 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1790  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 387 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.445453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  34.41 
 
 		 165 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  41.38 
 
 		 189 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 168 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04200  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 164 aa  46.2  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  42.86 
 
 		 197 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  40 
 
 		 194 aa  46.2  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 166 aa  46.2  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2488  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382497  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  37.93 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1156  HNH endonuclease  40.32 
 
 		 422 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  32.86 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 165 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  38.71 
 
 		 81 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  32.48 
 
 		 167 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  35.94 
 
 		 560 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0841  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4208  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 80 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  39.66 
 
 		 168 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4247  HNH endonuclease  37.1 
 
 		 80 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000485502  hitchhiker  0.0000000423624 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  36.71 
 
 		 218 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0119  putative type IV secretion system protein IcmJ/DotN  35.94 
 
 		 239 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  38.1 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 165 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  33.87 
 
 		 169 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2497  HNH endonuclease  30.77 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0383  HNH endonuclease  36.51 
 
 		 143 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  31.25 
 
 		 230 aa  43.5  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1599  HNH nuclease  24.14 
 
 		 226 aa  43.5  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0134694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 165 aa  42.7  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2082  RNA-directed DNA polymerase  28.33 
 
 		 635 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  40.62 
 
 		 379 aa  42.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  35.09 
 
 		 168 aa  42.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 174 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>